1937年7月，卢沟桥事件爆发，日本帝国主义开始全面侵华。8月，蒋介石同意将陕北中央红军改编为国民革命军第八路军，然后改编为第十八集团军。9月，国民党中央通讯社发布了中共中央正式形成抗日民族统一战线，以宣布国共合作，承认中共的合法地位。然而，美好的时光并没有持续多久。随着抗日战争的进行，国民政府出于整体战略的考虑，消极的抗日战争和反共活动越来越积极。他们盯着中共人民，监视、秘密逮捕、暗杀等活动源源不断地涌现。在顾全抗日大局的情况下，中共为调查和揭露反动派特务的秘密罪行展开了艰苦卓绝的斗争。
随着1938年西安事件的发生，这座十三朝古都备受关注。八路军高级参议宣侠父中将在西安公开演讲，向大家宣传救国救民的主张。宣侠父深受学生和群众的喜爱。他激情的演讲吸引了大量的人，甚至堵塞了西安的主干道。几辆车被人群堵在外面，坐在车里的人都是国民党的军政要员。他们是军统局局长张毅、中统局长葛寿芝、陕西省主席、西安行营主任蒋敬文。几个人看到宣侠父煽动和赢得了人们的心，都是铁青脸，心里打了自己的算盘。此外，西安警察局侦缉队长石应山和副队长侯文选也在现场。根据情况，石应山并不打算干预演讲，而是从远处观望。
在接下来的一段时间里，一直有人秘密地跟踪和监视宣侠父，宣侠父发现了一些东西，但并没有打草惊蛇。晚上，宣侠父像往常一样下班后骑自行车回家。黑暗中的一辆车上有人盯上了宣侠父。这群人似乎是国民党的一个组织。一路上，一个特务跟着宣侠父。宣侠父发现了他，甚至停下来和特务聊天。特务怕露馅逃跑。没想到特务刚拐进巷子，被三个人抓走了。原来有一群人盯上了宣侠父，但是这个特务被当成宣侠父抓走了。宣侠父觉得不对劲，立刻转身，停在一旁的车立刻追了上去，司机加了油门，向宣侠父撞了过去。天已晚，西安街头没有人，但这一切都被附近的一个酒鬼看到了，这一幕吓得酒鬼顿时醒来逃跑了。
第二天，宣侠父的警卫小杨发现宣侠父不见了，于是立即向西安八路军办汇报。云渠主任得知后非常震惊，立即动员下面的人去寻找，但一无所获。第二天，云主任不得不向中央政府报告这种情况，并要求指示。西安警察局已收到报告。导演杭丽将此案交给了师应山。师应山去了宣侠父的住所进行调查。结果，他发现了一个非常特殊的标志。这个标志是日本秘密组织菊剑，这意味着宣侠父的失踪可能与日本人有关。杭局长有意草草事，但师应山还是准备追查到底。
石英山来到一所老房子，里面住着一个特殊的人物。他是前Xi安中统负责人吴仲明。虽然他在家闲了两年，但他曾经和菊剑组织打过交道。Xi事件发生前，他指挥党调处一举歼灭了这个专门暗害爱国将领的菊剑组织。吴仲明身体不好，每天都要吃很多药，这让师应山大吃一惊。起初，吴仲明并没有问世事，但他还是听师应山讲完了事件的全过程，吴仲明觉得菊剑组织很有可能卷土重来。但武仲明觉得绑架宣侠父国民党的嫌疑更大，因为宣侠父的眼中钉比日本人更让国民党不舒服。
宣侠父的失踪引起了中共中央的强烈反应。在压力下，蒋介石特别成立了破坏敌人反抗行动的特别部署，并派葛寿芝和张毅前往西安，向中共推荐案件候选人。这个行动专署的水平很高，所以西安的军统和中统也开始准备搬家。很快，葛寿芝和张毅在西安行营看到了云渠，并逐一介绍了办案人选。西安军统负责人徐亦觉、西安中统负责人刘天章三人被云渠否决，因绑架宣侠父本人有重大嫌疑。所以每个人都把注意力集中在最后一个候选人身上，最后一个候选人实际上是武仲明，他已经休闲了两年。此时，吴仲明突然在街上晕倒，被送往医院。她是陕西省主席蒋敬文的侄女，接待了陕西省第一千金海归医生蒋宝珍。经过一番抢救，武仲明的病情得到了控制和清醒。此时，蒋宝珍已经看到了武仲明的病史和资料，知道了武仲明原中统的身份，甚至知道武仲明的病是他头部被枪伤留下的后遗症。看到蒋宝珍知道这么多，吴仲明质疑她的身份。这时，医院外出现了几名黑衣间谍。他们的目标是吴仲明。几个间谍不是吴仲明的对手。这时，葛寿芝出现了。葛寿芝还有一个身份。他是吴仲明和刘天章的老师。
葛寿芝为宣侠父的案子找到了武仲明。上级已正式任命武仲明破坏专署专员，并专门负责破获宣侠父的案件。这项任务得到了中共的认可。云渠认识武仲明的哥哥武伯英。葛寿芝借此机会支持武仲明，武仲明同等重视机遇和压力。第二天，在西北营地，西安各方齐聚一堂。看到吴仲明担任破反专员，大家都有不同的想法，而吴仲明则提出由各方成员组成破反专署。以郝连秀参谋为代表的八路军，军统徐亦觉、中统刘天章、侦缉队师应山都在名单上，虽然徐亦觉对吴仲明担任破反专员非常不满。就这样，破反专署正式成立。但吴仲明要想在西安有所作为，还需要两个人的支持，西北两只土虎蒋敬文和胡慕雄。
