祁钰心里知道上帝是故意庇护允贤临时命令东洋于朝堂上宣读的，所以她更讨厌允贤，把她禁足于万安宫。
南京水灾发生后，瘟疫传入北京。京中疫情危急。在太监曹吉祥的煽动下，祁钰想趁局势混乱，借东厂之手去除孙太后使用的五城兵马司白晋。没想到，被迫的白晋不仅把京城的大部分兵马带出了城市，还锁上了城门。京中因疫情死亡的尸体无法运出城门埋葬，疫情更加难以控制。
王美林建议祁钰和太后等着去内宫太液池的小岛避难。于东洋建议祁钰作为国主，此时应该坐在乾清宫，但祁钰却借此机会逃避。祁钰本想去万安宫接允贤一起去，但汪美林催他先走，并说她会派人去接允贤。允贤带着宫女绿香坐在汪美麟安排的去岛上的船上。船到了水中间。船上的小太监想把船凿下来。虽然允贤用木板打昏了太监，但船已经进水了，摇摇欲坠。因此，允贤和绿香掉进了水里，差点淹死。幸运的是，皇家药店的两名医生和女儿发现了他们，并用麻绳救了他们。
云贤带着皇家药房的医生和妇女出宫治疗瘟疫。云贤发现，这种瘟疫的症状与瓦拉蒙医生和她所说的黑死病非常相似。我记得蒙医用大黄汤治疗这种疫情，所以我计划用这种方法治疗瘟疫。太医起初质疑，但程村霞同意并采纳了云贤的建议。云贤看到一位老人的喉咙被痰卡住，咳喘不止，甚至想用嘴给老人吸痰。就在这时，上帝突然打开云贤，用手指给老人挖痰。结果证明，在首都发生瘟疫后，守卫南宫的太监们逃走了，皇帝走出了南宫。首先，他们检查了首都的瘟疫，其次，他们也希望在治疗瘟疫的医生中看到云贤。
上帝和云贤在城市里忙于治疗瘟疫，赢得了人民的心。上帝被人民和臣民视为治疗瘟疫的骨干，而云贤因其善良的手和仁慈被人们视为观音。在太医院男医生和皇家药房医女的共同治疗下，首都疫情得到有效控制。云贤一时兴起，建议带领医女与师兄领导的太医院竞争，看看哪里治愈了更多的病人。
云贤突发不适，疑似感染疫情。上帝很担心，用手摸了摸云贤的额头，看看她是否发烧了。祁钰得知疫情缓解，出宫检查。看到上帝对云贤做了亲密的举动，她立即把它拉开。祁钰命令村霞诊断云贤的脉搏。程村霞诊断云贤没有感染疫情，怀孕了，祁钰和人民都很开心。
